EC運営代行おすすめ会社を比較｜費用相場・メリット・サービス内容

ECサイトの運営において、リソース不足や売上の伸び悩みといった課題を抱えていませんか。日々の業務負担を軽減しつつ、専門的な知見を取り入れて事業を成長させたいと考える担当者の方は少なくありません。

本記事では、EC運営代行の導入を検討している方に向けて、おすすめの会社比較や費用相場、活用するメリット、具体的なサービス内容を詳しく解説します。

この記事を読むことで、代行サービスを利用する際の判断基準が明確になり、自社にぴったりの支援体制を築くための具体的なステップが分かります。

本記事のまとめ：EC運営代行の早見表

EC運営代行とは？ECサイト運営の業務を外部に委託するサービス

EC運営代行とは、ECサイト運営に関わる多岐にわたる業務を、専門知識やノウハウを持つ外部の企業に委託できるサービスです。

これらの業務を自社リソースだけで対応するのが難しい場合に、必要な部分もしくは全ての業務を代行してもらうことで、効率的なサイト運営と売上向上を目指します。

EC運営代行に依頼できる9つの業務内容

EC運営代行サービスに依頼できる業務は、ECサイトの運営に関わるほとんどの領域をカバーしています。

戦略立案のような上流工程から、日々の受注管理や顧客対応といった実務まで、企業の課題に応じて必要な業務を組み合わせて委託することが可能です。

ここでは、具体的にどのような業務を依頼できるのか、9つの項目に分けて解説します。

戦略設計・マーケティング企画

市場調査や競合分析、自社の強みを基に、EC事業全体の戦略を設計します。ターゲット顧客の設定、売上目標の策定、年間の販売計画やプロモーション計画の立案などが主な業務です。

ECサイトの構築・リニューアル

新規でEC事業を立ち上げる際のサイト構築や、既存サイトの課題を解決するためのリニューアルを依頼できます。デザインの作成からコーディング、カートシステムの選定・導入まで一貫して任せることが可能です。

商品登録・ささげ業務（撮影・採寸・原稿）

ECサイトで商品を販売するために不可欠な「ささげ業務」も代行可能です。

プロのカメラマンによる商品撮影、正確なサイズ測定、および購買意欲を高める商品説明文の作成まで、一括して委託できます。

Webサイトの更新・保守

ECサイトは構築して終わりではなく、定期的な更新と保守が不可欠です。

セキュリティ対策や、OS・ブラウザのアップデートに伴う表示崩れの修正なども含まれます。

集客施策（広告運用・SEO対策）

ECサイトの売上を伸ばすためには、新規顧客を集める集客施策が欠かせません。

費用対効果を最大化するための分析や改善提案まで含めて支援します。

SNSアカウントの運用

Instagram、X（旧Twitter）、FacebookなどのSNSアカウントの運用も代行可能です。

Instagram運用代行については以下の記事で詳しく紹介しています。

Instagram運用代行おすすめ比較｜費用・サービス内容・選び方を解説

Instagramを運用しているものの、思うようにフォロワーが増えない、あるいは投稿のネタが尽きてリソースが限界を迎えているという課題を抱えていませんか。 SNSが企業の認知度や売上に直結する現代において、I...

受注管理・在庫管理

顧客からの注文を受け付け、在庫を確認して出荷指示を出すまでの一連の受注管理業務を代行します。

複数のECモールに出店している場合に発生する複雑な在庫管理も、ネクストエンジンなどの一元管理システムを活用して正確に行います。

梱包・発送などの物流業務

商品の保管、ピッキング、梱包、そして顧客への発送といった物流業務全般を委託できます。自社で倉庫や人員を確保する必要がなくなり、物流コストの削減と業務効率化が実現します。

カスタマーサポート（電話・メール対応）

顧客からの問い合わせに対応するカスタマーサポート業務も代行可能です。商品に関する質問、注文内容の変更、返品・交換の手続きなど、電話やメールでの顧客対応を委託できます。

EC運営代行を利用する3つのメリット

EC運営代行を利用することで、企業は多くのメリットを享受できます。専門家の知見を活用した売上向上から、社内リソースの最適化、業務の効率化まで、その効果は多岐にわたります。

ここでは、EC運営代行を導入することで得られる主な3つのメリットについて、具体的に解説します。

EC運営のプロに任せて売上アップが期待できる

最大のメリットは、EC運営の専門家集団に業務を任せられる点です。

これにより、サイトの課題点を的確に修正し、売上アップを効率的に目指せます。

コア業務に集中でき生産性が向上する

EC運営には、受注処理や顧客対応、在庫管理といった多くのノンコア業務が存在します。

結果として、組織全体の生産性向上というメリットが生まれます。

最新のノウハウや専門スキルを活用できる

EC業界のトレンドや技術は日々進化しています。

これらの専門知識を自社で一から習得するには時間とコストがかかりますが、代行サービスを利用すれば、すぐに最新のノウハウを活用できるというメリットがあります。

EC運営代行を利用する際の3つのデメリット

EC運営代行は多くのメリットがある一方で、導入を検討する際にはいくつかのデメリットも理解しておく必要があります。ノウハウの蓄積や費用対効果、コミュニケーションに関する課題は、事前に認識しておくことで対策を講じることが可能です。

ここでは、起こり得る3つのデメリットについて解説します。

社内にEC運営のノウハウが蓄積されにくい

運営業務を全面的に外部委託すると、日々の運用の中で得られる知見やトラブル対応の経験などが社内に蓄積されにくくなります。

定期的なレポーティングやミーティングの場で、積極的に情報共有を求める姿勢が重要です。

依頼内容によっては費用対効果が悪くなる可能性がある

依頼する業務範囲と売上規模のバランスによっては、費用対効果が見合わなくなるケースがあります。

自社の事業フェーズや課題を明確にし、本当に必要な業務範囲を見極めて依頼することが、費用の無駄をなくす上で不可欠です。

情報共有や指示出しにコミュニケーションコストがかかる

外部のパートナーと連携するため、社内でのやり取りに比べて情報共有や意思決定に時間がかかる場合があります。

定期的なミーティングの設定や、明確な指示出し、迅速なフィードバックなど、円滑な連携体制を築くための工数が発生します。

EC運営代行の費用相場と料金体系

EC運営代行の費用は、依頼する業務範囲やサイトの規模、料金体系によって大きく異なります。

自社の予算や事業計画に合わせて最適なプランを選ぶために、それぞれの特徴と費用相場を理解することが重要です。

【月額固定型】毎月一定の費用で安定した運用が可能

月額固定型は、毎月一定の料金を支払うことで、契約範囲内の業務を代行してもらえるプランです。費用が固定されているため予算管理がしやすく、安定したサイト運用が可能です。

【成果報酬型】売上に応じて費用が変動するプラン

成果報酬型は、ECサイトの売上や利益に対して、事前に決められた料率を費用として支払うプランです。売上がなければ費用が発生しないため、初期費用を抑えたい場合に適しています。

費用相場は売上の10%〜30%程度が一般的ですが、契約内容によって変動します。

自社に最適なEC運営代行会社の選び方5つのポイント

数あるEC運営代行会社の中から、自社の事業成長に貢献してくれる最適なパートナーを見つけるためには、いくつかの重要なポイントを比較検討する必要があります。

依頼したい業務範囲との整合性や、自社が利用するプラットフォームへの対応可否、実績などを多角的に評価することが、依頼後のミスマッチを防ぐ鍵となります。

対応している業務範囲が自社の課題と合っているか

まず、代行会社の提供するサービス範囲と、自社が抱える課題が一致しているかを確認します。

自社の課題を明確にした上で、その解決に必要な業務をカバーしている会社を選びましょう。

自社が利用するECモールやカートシステムに対応しているか

EC運営代行会社には、それぞれ得意なECモールやカートシステムがあります。

特に、各モール特有の規約や販促手法に精通しているかは重要な選定基準です。

同業界や類似商材での実績は豊富か

自社が属する業界（アパレル、食品、化粧品など）や、取り扱っている商材と類似した商品の支援実績が豊富かどうかを確認しましょう。

具体的な成功事例などを提示してもらうと良いでしょう。

担当者とのコミュニケーションは円滑か

EC運営代行は長期的なパートナーシップとなるため、担当者との相性やコミュニケーションの円滑さは非常に重要です。

報告・連絡・相談の体制がしっかりしているかも確認すべきポイントです。

料金体系は予算や事業フェーズに見合っているか

代行会社の料金体系が、自社の予算や事業の成長段階に適しているかを確認します。月額固定型と成果報酬型のどちらが自社にとってメリットが大きいかを検討しましょう。

複数の会社から見積もりを取り、費用相場を比較することも重要です。

【強み別】おすすめのEC運営代行会社6社を比較

EC運営代行会社は、それぞれ得意とする業務やECプラットフォームが異なります。

そのため、単純に知名度や料金だけで選ぶのではなく、自社が抱えている課題と各社の得意分野を照らし合わせることが重要です。

ここでは対応範囲や特徴が異なる6社を紹介します。

なお、公開されている料金は基本的なプランの目安です。依頼する業務範囲や商品数、月間の受注件数、広告予算などによって実際の費用は変わるため、正式な料金は各社への問い合わせが必要です。

株式会社シード｜ECサイト構築から広告・SEOによる集客まで一貫して支援

株式会社シードは、ECサイトの構築とWebマーケティングを組み合わせた支援を得意とする会社です。

単にECサイトを制作するだけではなく、アフィリエイト広告、リスティング広告、SNS広告、SEO対策、LP制作など、サイト公開後の集客施策までまとめて相談できます。

また、シードは自社でもECサイトや楽天市場、Amazon、Qoo10などの運営経験を持っています。支援会社としての知識だけでなく、EC事業者側の運営経験を活かした提案が期待できます。

物流やコールセンターを含めたEC業務全体のアウトソーシングというよりも、次のような課題を抱える企業に適しています。

株式会社いつも｜戦略から物流までEC業務をワンストップで支援

株式会社いつもは、EC・D2C事業に関する幅広い支援を提供しているEC総合支援会社です。

EC事業の戦略立案やコンサルティングだけでなく、サイト制作・運営、広告・集客、受注処理、カスタマーサポート、物流まで、ECに必要な業務をワンストップで支援しています。

全国の物流拠点を活用したフルフィルメント支援も提供しているため、商品の保管、受注処理、出荷、カスタマーサポートを含めてEC運営全体を見直したい場合にも相談できます。

一方で、支援範囲が広く、企業ごとに提案内容が異なるため、料金は基本的に個別見積もりです。小規模な更新作業だけを依頼するというよりも、一定規模以上のEC事業を総合的に成長させたい企業に向いています。

複数の支援会社を個別に管理する負担を減らし、EC事業全体を一つの会社に相談したい企業に適しています。

サヴァリ株式会社｜楽天市場・AmazonなどのECモール運営に強い

サヴァリ株式会社は、楽天市場、Amazon、Yahoo!ショッピングなどのECモール運営を得意とする会社です。

ECモールの運営代行やコンサルティングにおいて、3,000社以上の支援実績を掲げています。モール運営経験者やネットショップの店長経験者など、ECの現場に詳しい人材が支援を担当する点が特徴です。

依頼できる業務には、販売戦略の立案、商品登録、商品ページ制作、広告運用、キャンペーン対応、メールマガジン配信、SNS運用などがあります。

公開されている主な料金プランは、次のとおりです。

実際の料金は店舗規模や商品数、依頼内容によって変わりますが、料金の目安が公開されているため、予算を検討しやすい点もメリットです。

楽天市場やAmazonに出店したものの、モール特有の仕組みを活用できていない企業や、社内に運営担当者が不足している企業に向いています。

コマースメディア株式会社｜Shopifyによる自社ECの構築と運営に強い

コマースメディア株式会社は、Shopifyを活用した自社ECサイトの構築や運営支援を得意とする会社です。

Shopifyの国内展開初期から構築・運営支援に取り組んでおり、現在はShopify Premier Partnerとして紹介されています。Shopifyによる新規サイト構築だけでなく、既存ECサイトからの移行、Shopify Plusの導入、アプリ設定、独自機能の開発にも対応しています。

また、構築後の運営代行、コンサルティング、広告運用、楽天市場やAmazonなどのモール運営、物流支援まで相談できます。

Shopifyサイトの構築費用は、サイト規模やカスタマイズ内容によって大きく異なります。同社が公開している目安では、小規模から中規模の構築で100万円～500万円程度、高度なカスタマイズを含む場合は500万円～1,000万円程度、大規模な構築では1,000万円以上となる場合があります。

そのため、低価格で簡易的なネットショップを開設したい企業よりも、次のような企業に向いています。

Shopifyを事業の中心となるEC基盤として活用したい企業に適した支援会社です。

ジャグー株式会社｜ECモールの売上と利益を重視した実行伴走型支援

ジャグー株式会社は、楽天市場、Amazon、Yahoo!ショッピング、Qoo10などのECモールを中心に、コンサルティングと運営代行を提供する会社です。

戦略や改善案を提示するだけではなく、広告運用、商品ページ制作、販促企画、店舗運営などの実務まで支援する「実行伴走型」を掲げています。

代表者や役員に楽天市場での勤務経験者がおり、楽天市場をはじめとするECモールの仕組みに詳しい点が特徴です。

対応業務には、次のようなものがあります。

料金は依頼内容に応じた個別見積もりです。楽天市場やAmazonなどで一定の売上があり、次の成長段階を目指している企業や、社内担当者と連携しながら実務を進めてほしい企業に向いています。

トランスコスモス株式会社｜物流・受注処理・顧客対応まで含む大規模EC支援

トランスコスモス株式会社は、ECサイトの構築・運営から物流、カスタマーサポートまでを一括して支援するECワンストップサービスを提供しています。

対応範囲には、ECサイトの構築・運営、Webプロモーション、データ分析、受注処理、商品の保管、ピッキング、梱包、発送、返品対応、問い合わせ対応などが含まれます。

ECサイトのフロント部分だけでなく、商品購入後のバックオフィス業務まで委託できる点が特徴です。

Shopifyの公式パートナーとしてサイト構築を支援しているほか、国内ECモールの売上拡大支援や越境ECにも対応しています。国内外に複数の拠点や業務基盤を持つため、複数ブランドや大量の受注を抱える大規模ECにも対応しやすい会社です。

一方で、業務範囲や企業規模に応じて個別にサービスが設計されるため、料金は原則として問い合わせが必要です。

日常的なサイト更新だけを依頼したい小規模事業者よりも、EC事業の複雑な業務基盤をまとめて再構築したい中堅・大手企業に適しています。

集客やマーケティングを強化したいなら株式会社シード

ECサイトへのアクセス数や購入数に課題を感じている場合は、Webマーケティングに強い運営支援会社を選ぶことが重要です。

ECサイトは、デザインや機能を整えるだけでは売上につながりません。検索エンジン、Web広告、SNS、アフィリエイトサイトなど、複数の経路から継続的に見込み顧客を集める必要があります。

株式会社シードでは、ECサイト構築に加えて、アフィリエイト広告、リスティング広告、SNS広告、SEO対策、LP制作、LPOなどを組み合わせた集客支援を提供しています。

特にアフィリエイト広告については、20年以上の運用実績を掲げており、複数のASPとの調整、提携メディアの開拓、掲載内容の管理、成果分析などをまとめて相談できます。

ECサイトの構築・改善とWeb集客を一社へまとめて依頼することで、広告の流入先となる商品ページやLPまで含めた一貫性のある改善を進めやすくなります。

EC運営代行とECコンサルの違いとは？

EC運営代行とECコンサルは、どちらもEC事業者を支援するサービスですが、その役割には明確な違いがあります。自社に必要なサポートが「実務の代行」なのか、「戦略的な助言」なのかを判断するために、両者の違いを正しく理解しておくことが重要です。

ここでは、それぞれのサービス内容の違いとは何かを解説します。

EC運営代行は「実務」を代行するパートナー

EC運営代行は、その名の通り、EC運用の実務を代行するサービスです。商品登録、広告運用、受注管理、顧客対応といった、日々のオペレーション業務を実行する役割を担います。

リソース不足を補い、業務を効率化したい企業にとっての実行部隊となるパートナーです。

ECコンサルは「戦略立案や分析」を支援するアドバイザー

一方、ECコンサルは、EC事業の課題を分析し、売上向上のための「戦略立案や改善策の提案」を行う専門家です。市場分析やデータ解析を基に、どのような施策を打つべきかといった助言を行います。

EC運営代行に関するよくある質問

ここでは、EC運営代行の利用を検討している方からよく寄せられる質問とその回答をまとめました。

EC運営代行の費用はどのくらいかかりますか？

費用は月額固定型か成果報酬型かで異なります。

依頼範囲やサイト規模によって費用は大きく変動するため、複数の会社から見積もりを取ることをおすすめします。

EC運営代行ではどこまでの業務を依頼できますか？

戦略立案からサイト構築、商品登録、集客、受注管理、物流、顧客対応まで、EC運営に関わるほぼ全ての業務を依頼可能です。

自社の課題に合わせて、必要なサービスだけを部分的に委託することもできます。多くの会社が柔軟なプランを提供しています。

小規模なECサイトでも運営代行を依頼できますか？

はい、依頼可能です。多くの代行会社がサイトの規模を問わずサービスを提供しています。

まとめ｜EC運営代行は株式会社シードにお任せください

EC運営代行は、専門的なノウハウを活用して売上向上を目指すと同時に、社内のリソースをコア業務に集中させるための有効な手段です。

ECサイトの売上を伸ばすためには、サイトを制作するだけではなく、SEO対策やリスティング広告、アフィリエイト広告、SNS広告などを組み合わせた継続的な集客施策と改善が欠かせません。

株式会社シードでは、ECサイト構築から運営改善、SEO対策、アフィリエイト広告運用代行、リスティング広告、SNS広告まで一貫して支援しています。EC-CUBEブロンズパートナーとして培った構築ノウハウに加え、20年以上にわたるWebマーケティングの実績を活かし、サイト制作だけで終わらない「売上につながるECサイト運営」をサポートします。